Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6871L7N248 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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