Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms