Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5294J3QP53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5294J3QP53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms