Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20914J3QME2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20914J3QME2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms