Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms