Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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