Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms