Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms