Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms