Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef1G3X9K3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef1G3X9K3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms