Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms