Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NpcdF8VQB8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms