Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6F8VPZ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6F8VPZ5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms