Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms