Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28048F7BCN0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms