Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm20538F6Z9R1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms