Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Gm10378F6XQQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm10378F6XQQ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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