Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zfp988F6VKC7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms