Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933403O08RikF6UK53 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms