Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms