Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod3E9QA62 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmod3E9QA62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms