Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ccdc7bE9Q9Y3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ccdc7bE9Q9Y3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms