Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930451I11RikE9Q9R3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms