Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms