Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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