Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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