Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms