Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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