Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdr1E9Q0B4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms