Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm4450E9Q007 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms