Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd2E9PZM4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms