Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc8E9PWG2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms