Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms