Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms