Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3252E9PUT9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms