Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms