Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms