Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hfm1D3Z4R1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hfm1D3Z4R1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms