Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms