Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd1D3YXK1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms