Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam47eD3YWC7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam47eD3YWC7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms