Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cfap70D3YVL2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cfap70D3YVL2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms