Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5475D3YV11 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms