Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms