Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna7C0LLJ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms