Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nxpe3B9EKK6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms