Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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