Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd8B9EJ80 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms