Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clip3B9EHT4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms