Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms